1.基因命名规则是怎样的
限制性内切酶的命名法 已发现的限制酶种类众多,Smith H O和Nathans D与1973年提出了一个命名系统,已被学术界接受,其命名原则是根据分离出这种酶的细菌的分类学上的属名,种名和菌株名来命名。
酶的名称的第一个字母是该细菌属名的第一个字母,大写,斜体。 名称的第二,三个字母是该细菌中分离出来的几种酶的序号。
如分离出的第一种酶为Ⅰ,第二种酶为Ⅱ。 一下举例说明:AluⅠ的得名为从中分离出的细菌属名和种名为Arthrobacter luteus,分离得到的第一种酶。
从细菌Bacillus amyloliquefuciens H菌株分离出来的第一种酶命名为BamHⅠ 从Haemophilus influenzae Rd菌株中分离出来的第三种酶的命名为Hind Ⅲ.。
2.基因的缩写必须写斜体吗
是的。
这是国际命名委员会规定的,基因名字必须用小写斜体字母表示,蛋白第一个字母大写,不要斜体。现在比较正规的杂志社就要求按规定书写。
如果已知,直接根据其两端序列,设计引物,采用PCR的方法直接可将该基因扩增出来。
若为已知功能的未知基因,则根据其相近物种中的相似基因设计引物,然后PCR。 若为未知基因或者筛选基因,可用随机引物的办法扩增并可辅助其他方法进行。
扩展资料:
RAD-seq虽说方法很多,但是文库构建流程大致如下,不同方法在其中某些步骤存在差异
起始基因组DNA量:能否允许降解FNA
限制性内切酶酶解:限制酶种类,数量
酶切位点结合接头:接头类型
酶解片段大小选择:直接选择,间接选择
添加barcode混池:视v接头而异
测序类型选择:单端,双端
两者的差异在于,
1)是现进行酶切然后随机破碎,最后仅选择存在酶切位点片段测序;
2)也是酶切,但是后续直接选择合适大小的片段测序
因此相对于
测序的位点平均会少一点,也就会导致同一批样本后者利用率低于前者。无参考基因组更推荐前者,而不是后者。
参考资料来源:百度百科——基因
3.如何正确使用基因/蛋白质的名称格式
1 一般规则 在你的文章中使用大家都认可的基因/蛋白质的名称和符号(见下文) 有时认可的基因/蛋白质的名称或符号已经不再有效。
这种情况下,第一次提到的基因/蛋白质,需要先列出经批准的名称,然后再添加括号说明(以前被称为XXX)。例如,“我们使用抗POU5F1蛋白的抗体(以前称为OCT-4)。”
注意使用正确的符号,而不是以往的名称。
2 不同物种有不同的规则 1) 小鼠 / 大鼠 / 鸡 (1)一般命名规则(适用于小鼠,大鼠和鸡): 基因的全名不用斜体,也不用希腊字母 例如:insulin-like growth factor 1(胰岛素样生长因子1) 基因符号不用希腊字母和连字符,使用斜体,第一个字母大写,其余小写 例如:Igf1 (斜体)(胰岛素样生长因子1) 蛋白质的名称和基因符号相同,但不用斜体,并全部大写 例如:IGF1 mRNA和cDNA的基因符号和规定的格式 例如: "。 levels of Igf1 (italicized) mRNA increased when。
" 首次提到的突变等位基因应该详细列出 例如:Igf1tm1Arge/Igf1tm1Arge (italicized) is one of several knockout alleles of Igf1 (italicized) 所有字母和数字用斜体,等位基因的符号(tm1Arge)要用上标 经前面详细描述之后,敲除的纯合子可表示为Igf1-/- (所有字母均用斜体,并且- / -用上标);杂合子为Igf1 + / - 等。 (2)对于这些命名规定的详细信息,请参阅: 2) 人类/非人类灵长类动物/家畜/ 除了小鼠、大鼠、鱼、昆虫、苍蝇外默认的其他物种 完整的基因名称不用斜体和希腊字母 例如:insulin-like growth factor 1(胰岛素样生长因子1) 基因符号不使用希腊字母和连字符,基因符号用斜体,所有的字母用大写 例如:IGF1(斜体) 蛋白质的名称与基因符号相同,但不用斜体,并全部大写 例如:IGF1 mRNA和cDNA的基因符号和规定的格式 例如:"。
levels of IGF1 (italicized) mRNA increased when。" 3) 鱼(适用于所有的鱼) 完整的基因名称用斜体表示,全部用小写字母,不要用希腊字母 例如:cyclops(斜体) 基因符号用斜体,全部小写 例如:cyc(斜体) 蛋白质命名与基因符号相同,但仅首字母大写,也不用斜体 例如:Cyc。
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